Get started
Author

Olga V. Mitrofanova

Observed names: Mitrofanova, Olga, O Mitrofanova, O. V. MITROFANOVA, O. V. Mitrofanova, O.V. MITROFANOVA, O.V. Mitrofanova, O.V. Mitrofanova Mitrofanova, Olga Mitrofanova, Olga V. MITROFANOVA, Митрофанова, О.В., О. В. Митрофанова, О.В. МИТРОФАНОВА
ORCID: 0000-0003-4702-2736
Observed ORCID: 0000-0003-4702-2736
OpenAlex ID: A5101886420
Molecular-genetic bases of plumage coloring in chicken
2019 · A. V. Makarova, O. V. Mitrofanova, et al. · Vavilov Journal of Genetics and Breeding · 58
PDF
Evolutionary Subdivision of Domestic Chickens: Implications for Local Breeds as Assessed by Phenotype and Genotype in Comparison to Commercial and Fancy Breeds
2021 · Tatyana A. Larkina, Olga Y. Barkova, et al. · Agriculture · 40
PDF
Genome-wide association studies targeting the yield of extraembryonic fluid and production traits in Russian White chickens
2019 · Andrei A. Kudinov, Natalia V. Dementieva, et al. · BMC Genomics · 40
PDF
Genetic Variability in Local and Imported Germplasm Chicken Populations as Revealed by Analyzing Runs of Homozygosity
2020 · Natalia V. Dementieva, Andrei A. Kudinov, et al. · Animals · 30
PDF
Risk of Sperm Disorders and Impaired Fertility in Frozen–Thawed Bull Semen: A Genome-Wide Association Study
2024 · Natalia V. Dementieva, Artem P. Dysin, et al. · Animals · 27
PDF
Studying the Structure of a Gene Pool Population of the Russian White Chicken Breed by Genome-wide Snp Scan
2017 · N.V. Dementeva, M.N. Romanov, et al. · Sel skokhozyaistvennaya Biologiya · 23
Association of polymorphic variants in MSTN, PRL, and DRD2 genes with intensity of young animal growth in Pushkin breed chickens
2017 · O. V. Mitrofanova, N. V. Dementeva, et al. · Cytology and Genetics · 22
Genome-wide association study for frozen-thawed sperm motility in stallions across various horse breeds
2022 · Elena V. Nikitkina, Natalia V. Dementieva, et al. · Animal Bioscience · 21
PDF
Comparative Analysis of Molecular RFLP and SNP Markers in Assessing and Understanding the Genetic Diversity of Various Chicken Breeds
2022 · Natalia V. Dementieva, Yuri S. Shcherbakov, et al. · Genes · 16
PDF
Genetic Variability of Indels in the Prolactin and Dopamine Receptor D2 Genes and Their Association with the Yield of Allanto-Amniotic Fluid in Russian White Laying Hens
2020 · Michael ROMANOV, Natalia V. DEMENTIEVA, et al. · Tarım Bilimleri Dergisi · 10
PDF
Haplotype structure and copy number polymorphism of the beta‐defensin 7 genes in diverse chicken breeds
2017 · M. O. Lee, M. N. Romanov, et al. · Animal Genetics · 9
PDF
The Genetic Diversity of Stallions of Different Breeds in Russia
2023 · Natalia Dementieva, Elena Nikitkina, et al. · Genes · 6
PDF
Analysis of the genetic diversity of Ayrshire cattle in Russia (part 1)
2022 · Marina V. Pozovnikova, Olga V. Tulinova, et al. · Ecological genetics · 6
Efficiency of using SNP markers in the MSTN gene in the selection of the Pushkin breed chickens
2020 · N. V. Dementeva, A. B. Vakhrameev, et al. · Vavilov Journal of Genetics and Breeding · 6
PDF
The rate of weight gain and productivity of a chicken broiler cross with various polymorphic types of the myostatin gene
2017 · N. V. Dementeva, O. V. Mitrofanova, et al. · Russian Journal of Genetics Applied Research · 6
СВЯЗЬ ПОЛИМОРФНЫХ ВАРИАНТОВ ГЕНА СТЕАРОИЛ-КоА-ДЕСАТУРАЗА (SCD1) С ХОЗЯЙСТВЕННО ЦЕННЫМИ ПРИЗНАКАМИ В РОССИЙСКОЙ ПОПУЛЯЦИИ КОРОВ АЙРШИРСКОЙ ПОРОДЫ
2017 · Всероссийский НИИ генетики и разведения сельскохозяйственных животных, филиал ФГБНУ Федеральный научный центр животноводства — ВИЖ им. академика Л.К. Эрнста, М.В. ПОЗОВНИКОВА, et al. · Sel skokhozyaistvennaya Biologiya · 5
The rate of weight gain and productivity of chicken broiler cross with various polymorphic types of myostatin gene
2016 · N. V. Dementeva, O. V. Mitrofanova, et al. · Vavilov Journal of Genetics and Breeding · 5
PDF
WPSI-6 Chicken resource population as the source of study genetic improvement of indigenous breeds.
2018 · N Dementiva, A Kudinov, et al. · Journal of Animal Science · 4
Genome-wide analysis of across herd F st Heterogeneity in holsteinized cattle
2016 · M. G. Smaragdov, E. I. Saksa, et al. · Russian Journal of Genetics · 4
Analysis of the accumulation of homozygosity regions in chickens of the Pushkin breed using data from whole genome genotyping
2022 · Natalia V. Dementieva, Yuri S. Shcherbakov, et al. · Ecological genetics · 3
Assessment of variability of egg production traits based on analysis of SNP markers and search for traces of selection in the genome of Russian white chickens
2020 · Olga V. Mitrofanova, Natalia V. Dementieva, et al. · Ecological genetics · 3
Н.В. ДЕМЕНТЬЕВА1, М.Н. РОМАНОВ1, 2, А.А. КУДИНОВ1, О.В. МИТРОФАНОВА1, О.И. СТАНИШЕВСКАЯ1, В.П. ТЕРЛЕЦКИЙ1, Е.С. ФЕДОРОВА1, Е.В. НИКИТКИНА1, К.В. ПЛЕМЯШОВ1 Популяция русских белых кур селекционировалась в генофондном хозяйстве Всероссийского НИИ генетики и разведения сельскохозяйственных животных (ВНИИГРЖ) в течение 25 поколений с использованием индивидуального подбора. Особенности этой породы — устойчивость к пониженной температуре выращивания в ранний постнатальный период и белый цвет эмбрионального пуха. В 2002-2012 годах ее разведение осуществлялось методом панмиксии, и к настоящему времени на основе сохранившегося поголовья сформирована новая популяция русских белых кур. Нашей целью было показать возможности полногеномного SNP-сканирования (single nucleotide polymorphisms) для изучения генетических особенностей структуры популяции малочисленных пород кур отечественного происхождения и динамические изменения молекулярной архитектуры на примере сравнения современной популяции русской белой породы с предковой популяцией 2001 года. Были проанализированы две группы кур: популяция 2001 года (6 гол., неродственные особи из двух линий) и современная популяция (156 гол.). SNP-анализ включал скрининг 162 образцов ДНК с помощью микрочипа Illumina Chicken 60K SNP iSelect BeadChip («Illumina», США). Контроль качества генотипирования, определение генетической структуры популяции методом многомерного шкалирования (multidimensional scaling, MDS), расчет показателей неравновесного сцепления (linkage disequilibrium, LD) и частоты встречаемости аллеей по группам проводили в программе PLINK 1.9. Построение модели разграничения кластеров на основе SNP-генотипов осуществляли с использованием программы ADMIXTURE. По результатам MDS-анализа современная популяция была условно разделена на четыре MDS-группы, что в сравнении с данными родословной адекватно отражает происхождение изученных особей. Представители предковой популяции были генетически сходны с группой MDS3. С применением F-статистики многофакторного дисперсионного анализа выявлено достоверное влияние группы, хромосомы, хромосомы в группе и дистанции между SNP-маркерами на значения LD (r2). В группе 2001 года по всем хромосомам наблюдались максимальные показатели r2 и высокая частота встречаемости LD, равного 1, при расстоянии между SNP-маркерами 500-1000 Кб. Количество мономорфных аллелей в этой группе также было самым высоким. На основании SNP-анализа сделан вывод о том, что современная популяция русских белых кур характеризуется распадом длинных LD-районов предковой популяции. Моделирование кластеров в программе ADMIXTURE выявило различия между группами современной популяции, определенными с помощью MDS-анализа. Группы, сформированные из особей, входящих в MDS1 и MDS2, имели однородную структуру и различались между собой при K = 4 и K = 5. Группа MDS4 образовывала генетически неоднородный кластер, отличающийся от групп MDS1 и MDS2 при значениях K от 2 до 5. Группа MDS3 была филогенетически близка к популяции 2001 года (при K от 2 до 5). Таким образом, анализ современной генофондной популяции русских белых кур показал ее неоднородность и сходство группы MDS3 с предковой популяцией 2001 года, которая, в свою очередь, характеризовалась большим числом мономорфных аллелей и высокой частотой встречаемости длинных LD-районов. SNP-сканирование позволило оценить генетическое сходство особей и популяционную структуру русской белой породы кур. Понимание генетической структуры важно при панмиктическом разведении и отслеживании исторических изменений в молекулярной организации генома генофондной популяции с ограниченным поголовьем. Ключевые слова: структура популяции, генетическое разнообразие, SNP-сканирования, русская белая порода кур. Полный текст STUDYING THE STRUCTURE OF A GENE POOL POPULATION OF THE RUSSIAN WHITE CHICKEN BREED BY GENOME-WIDE SNP SCAN N.V. Dementeva1, M.N. Romanov1, 2, A.A. Kudinov1, O.V. Mitrofanova1, O.I. Stanishevskaya1, V.P. Terletsky1, E.S. Fedorova1, E.V. Nikitkina1, K.V. Plemyashov1 A population of the Russian White chickens, bred at the gene pool farm of ARRIFAGB for 25 generations using individual selection, is characterized by resistance to a lowered temperature in the early postnatal period and white colour of the embryonic down. In 2002-2012, breeding was carried out by panmixia, and by now a new population of the Russian White chickens has been formed on the basis of the surviving stock. Comparison of the genetic variability of this population and the archival DNA of representatives of the 2001 population using microarray screening technology will help to assess the population structure and the preservation of the unique characteristics of its genome. The material for the study was DNA extracted from 162 chicken blood samples. Two groups of the Russian White breed were studied, the 2001 population and the current population. Genome-wide analysis using single nucleotide markers (SNP) included screening by means of the Illumin
2017 · Всероссийский НИИ генетики и разведения сельскохозяйственных животных, филиал ФГБНУ Федеральный научный центр животноводства — ВИЖ им. академика Л.К. Эрнста, Н.В. ДЕМЕНТЬЕВА, et al. · Sel skokhozyaistvennaya Biologiya · 3
Evaluation of genetic diversity of reindeer (Rangifer tarandus) by means of multilocus DNA fingerprinting
2011 · V. V. Goncharov, O. V. Mitrofanova, et al. · Russian Agricultural Sciences · 3
Investigation of the characteristics of genetic heterogeneity of chicken breeds and experimental populations on the basis of DNA polymorphism analysis
2007 · O. V. Mitrofanova, V. I. Tyshchenko, et al. · Russian Agricultural Sciences · 3
Association between Fertility HCD Haplotype, Milk Production, and Reproductive Performance in Holstein Cows
2021 · M. V. Pozovnikova, O. K. Vasileva, et al. · Russian Agricultural Sciences · 2
Works count: 54
Citation count: 365
H-index: 10
I10-index: 10
Year
Topic
Type