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Identifizierung und Charakterisierung von Long COVID19Patienten durch VollblutTranskriptomik

Description: Immer mehr Hinweise deuten auf eine steigende Prävalenz von Long COVID-19 hin, ein kürzlich geprägter Begriff für nicht genesene Patienten mit persistierenden klinischen Symptomen für mehr als sechs Monate nach akutem COVID-19. Obwohl ein dereguliertes Immunsystem als mögliche Ursache postuliert wurde, gibt es derzeit keine Möglichkeit, Long COVID-19-Patienten frühzeitig nach akutem COVID-19 zu identifizieren. Wir haben vor kurzem Vollblut-Transkriptomik genutzt, um Krankheitsklassifikatoren für akutes COVID-19 zu erstellen, sowie die Heterogenität der Krankheit anhand von molekularen Phänotypen zu analysieren. Das DeCOI (Deutsche COVID-19 Omics Initiative) Netzwerk hat an mehreren Standorten in Deutschland Patientenkohorten etabliert, die sich bereits als äußerst wertvoll für die Analyse und das Verständnis des akuten COVID-19 erwiesen haben. Indem wir klinische Wissenschaftler, DFG-geförderte Sequenzierzentren und Computerexperten zusammenbringen, werden wir das Wissen und die Expertise in klinischer Infektiologie, Genomik und maschinellem Lernen kombinieren, um Long COVID-19 besser zu charakterisieren. Wir werden die Proben aus diesen Kohorten verwenden, um Vollblut-Transkriptom-Signaturen und Klassifikatoren zu erstellen um Long COVID-19 Patienten zu identifizieren und ihre molekularen Phänotypen zu bestimmen, um die Heterogenität der Krankheit aufzuklären. Darüber hinaus werden wir eine mögliche genetische Suszeptibilität für Long COVID-19 durch die Analyse aberranter Expression identifizieren und mikrobielle Profile aus dem Blut als potenzielle Biomarker untersuchen. Zusammengenommen werden diese Analysen die Identifizierung molekularer Mechanismen der Long COVID-19 bezogenen Biologie und potenzieller therapeutischer Ziele für die weitere Nutzung in klinischen Studien ermöglichen.
Amount: €4,178,000
Funding type: grant
Funder scheme: Sachbeihilfen
Start date: 2021-01-01
End date: 2023-12-31
Funded outputs count: 20
Funder award ID: 466168626
OpenAlex ID: G3383152245
2025 · Emma S Hoffmann, Lara Hombrecher, et al. · Nucleic Acids Research · 4
2025 · Ioanna Gemünd, Lorenzo Bonaguro, et al. · Cell Reports Methods · 2
2025 · Friederike Grandke, Tobias Fehlmann, et al. · Nature Communications · 17
2024 · Charlotte Kröger, Sophie Müller, et al. · Nature Communications · 19
2024 · Leidy-Alejandra G Molano, Pascal Hirsch, et al. · Nucleic Acids Research · 80
2024 · Shusruto Rishik, Pascal Hirsch, et al. · Nucleic Acids Research · 75
2024 · Ioanna Gemünd, Lorenzo Bonaguro, et al. · bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
2024 · Joachim Schultze, Shobhit Agrawal, et al. · Research Square · 1
2023 · Sophie Müller, Charlotte Kröger, et al. · European Journal of Immunology · 28
2023 · Ines F. Scheller, Karoline Lutz, et al. · The American Journal of Human Genetics · 54
2023 · Matthias Flotho, Jérémy Amand, et al. · Nucleic Acids Research · 14
2023 · Pascal Hirsch, Azat Tagirdzhanov, et al. · Nucleic Acids Research · 19
2023 · Ernesto Aparicio-Puerta, Pascal Hirsch, et al. · Nucleic Acids Research · 114
2023 · Ines F. Scheller, Karoline Lutz, et al. · medRxiv · 7
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