Organisation et structure des génomes mitochondriaux des algues brunes Pylaiella littoralis et Laminaria digitata
Year: 2000
Type: dissertation
Abstract: Deux études de génomes mitochondriaux d'algues brunes sont présentées. La 1ère concerne celui d'une algue primitive Pylaiella littoralis. La 2nde est le début de la comparaison avec celui de Laminaria digitata, considérée comme évoluée. Le contexte de ces études est décrit : la 1ère partie traite des endosymbioses ayant conduit aux mitochondries et aux plastes ; une autre concerne la définition des algues brunes et la 3ème traite des mitochondries et de leur génome. L'ADN mitochondrial (ADNmt) de P. littoralis et de L. digitata consiste en molécules circulaires de 58507 pb et de 36k pb, respectivement. Celui de P. littoralis contient à la fois des promoteurs de type eubactérien et un gène d'ARN polymérase de type phagique. Ce génome code plusieurs gènes de protéines ribosomiques, dont rpl31, identifié avant uniquement dans l'ADNmt d'un protiste primitif, Reclinomonas americana. Il code aussi des introns des groupes IIA et IIB, avec des ORFs multidomaines complets. Le gène nad11 ne comporte que le 1er tiers du gène habituel, soit celui des domaines de liaison aux groupements FeS, dont l'importance a été montrée pour l'activité de l'enzyme. L'autre partie n'est pas codée dans l'ADNmt et n'a pas été détectée dans l'ADN nucléaire. Le gène cox2, lui, comporte une insertion de 1006 aa alors qu'il n'en code lui-même que 280. L'ADNmt de P. littoralis a conservé plus de caractères primitifs que ceux des autres eucaryotes tout en ayant plus évolué que celui de R. americana. Les 60% du génome mitochondrial de L. digitata qui sont séquencés ressemblent étonnamment à celui de P. littoralis. L'ordre des gènes est presque identique et leurs séquences ont de très fortes homologies. Les principales différences sont l'absence des introns et la plupart des ORFs. Nous avons aussi fait plusieurs comparaisons ponctuelles avec d'autres algues brunes qui pourraient être un outil utile dans l'étude des relations phylogénétiques de la lignée des algues brunes, encore peu connue.
Source: HAL
Author: Marie-Pierre Oudot Le Secq
Language: French
Domain: Life Sciences
Open Access status: green
OpenAlex ID: W1604401984