Blood gene expression, lifestyle and diet The Norwegian Women and Cancer Post-genome Cohort
Year: 2013
Type: dissertation
Abstract: Livsstil og kosthold er risikofaktorer for kreft, kardiovaskulære og inflammatoriske sykdommer, men hvilke molekylære mekanismer som er involvert er ikke fullt ut beskrevet.\nTeknologi som microarray (mikromatriser) brukes i stor grad for å utforske disse mekanismene, men resultater fra modellsystemer som cellekulturer og forsøksdyr reflekterer ikke nødvendigvis menneskets biologi så godt som man tidligere har trodd.\nMålet med denne doktorgradsavhandlingen var å utforske muligheten for å bruke blodprøver fra en populasjsonsbasert kohorte, for å analysere genuttrykksprofiler og dermed identifisere\nmolekylære mekanismer relatert til ulike livsstils- og kostholdsfaktorer.\nKvinner og Kreft-studien er en nasjonalt representativ, prospektiv kohorte som ble startet i 1991, for å forske på risikofaktorer for brystkreft. Studien inkluderer i dag mer enn 172 000 kvinner, som har svart på spørreskjema angående livsstil, kosthold, og helse. I 2003-06 ble ca. 50 000 av deltakerne tilfeldig plukket ut for å delta i Kvinner og Kreft Post-genom kohorten.\nFra disse kvinnene ble det samlet inn blodprøver med mulighet for genuttrykksanalyse, samt\nen standard blodprøve og et spørreskjema. Til denne avhandlingen ble det brukt materiale fra\n500 kvinner i Post-genom kohorten. Fullgenom genuttryksanalyser ble uført, i tillegg til\nmåling av konsentrasjon av fettsyrer og vitamin D i plasma. I artikkel I ble genuttrykk relatert\ntil livsstilseksponeringer (røyking, medisinbruk), inter-individuell variasjon (alder,\nkropsmasseindeks, fastestatus), og tekniske faktorer (pre-analytiske og analytiske) utforsket. I artikkel II og III ble genuttrykk relatert til vitamin D og fettsyreratioer analysert, og disse artiklene kan sies å være en del av forskningsfeltet “nutrigenomics”. På grunn av deres delvis overlappende kostholdskilde, fet fisk, ble samvariasjon mellom vitamin D og fettsyreratioer analysert i artikkel IV.\nTeknisk variasjon påvirket genuttrykksprofilene i stor grad, noe som peker på behovet for tett\nkontroll av preanalytiske og analytiske prosedyrer. Inter-individuelle faktorer og ulike\neksponeringer var assosiert med differensielt uttrykk både av enkeltgener og av signalspor.\nVitamin D-status var assosiert med beskjedne forskjeller i genuttrykk. Likevel fant vi, på\nsignalspornivå, flere immunologiske prosesser. Dette støtter hypotesen om at vitamin D kan\nvære immunregulatorisk. Ratioen mellom flerumettede fettsyrer tilhørende n-6 eller n-3-\nfamiliene var assosiert med differensielt uttrykk av både enkeltgener og signalspor, og pekte ut\nprosesser som kan bli påvirket av ulike typer fett fra kosten. Konsentrasjonene av vitamin D\nog fettsyreratioer var kun svakt assosiert med hverandre, noe som indikerer at\ngenuttrykksprofilene oppstår som følge av uavhengig påvirkning fra disse to\nkostholdsfaktorene.\nFunnene i avhandlingen viser at ulike typer eksponeringer relatert til livsstil og helse, i tillegg\ntil teknisk variasjon, gjenspeiles i genuttrykksprofiler i blod. Dette antyder at\ngenuttrykksanalyser i blodprøver kan bli et viktig verktøy for å identifisere molekylære\nmekanismer relatert til ulike typer eksponeringer, for å karakterisere sykdomsprosesser, og for\nå forutsi risiko for sykdom.
Author: Karina Standahl Olsen
Language: English
Subfield: Genetics
Domain: Life Sciences
Open Access status: green
OpenAlex ID: W2171305377