The Application of LC-MS/MS Technology for Proteomic Analysis of Gingival Tissue: a Pilot Study
Year: 2013
Type: article
Abstract: SažetakSvrha: Željelo se pronaći optimalne uvjete i metode za identifikaciju maksimalnog broja proteina u uzorcima tkiva gingive pacijentice s agresivnim parodontitisom.Pritom smo se koristili tehnologijom Label-free kvantifikacije, tekućinske kromatografije i spektrometrije masa (LC -MS/MS), te usporedili proteom zdravih i bolesnih uzoraka tkiva gingive.Materijali i metode: Četiri uzorka gingivnog tkiva (dva zdrava i dva bolesna) uzeta su od pacijentice, inače nepušačice, koja boluje od teškog oblika generaliziranog agresivnog parodontitisa.Proteini tkivnog lizata razdvojeni su 1D gel-elektroforezom nakon koje je slijedila digestija u gelu te mjerenje proteina nanoljestvicom HPLC-sistema preko nanoelektro spreja, ionizacijskog izvora i spektrometra mase.Dobiveni podaci obrađeni su u programu MaxQuant.Rezultati: Label-free kvantifikacija i LC-MS/MS analiza, zajedno s pripremom uzoraka, 1D gel-elektroforezom i digestijom u gelu pokazali su se kao učinkovita metoda za analizu proteoma gingivnog tkiva.Ukupan broj identificiranih i kvantificiranih proteina iznosio je 2429.Proteini koji su pokazali pojačanu ekspresiju u tkivu zahvaćenom agresivnim parodontitisom bili su: imunoglobulinski gama-1 lanac regije C, imunoglobulinski kapa lanac regije C i imunoglobulinski gama-3 lanac regije C (Ig gamma-1 chain C region, Ig kappa chain C region i Ig gamma-3 chain C region), a desmoplakin, aneksini, proteini S100-A8/A9 i keratini pokazali su sniženu ekspresiju.Zaključak: Ovo eksperimentalno istraživanje omogućuje novi uvid u proteomski profil zdravog i bolesnog gingivnog tkiva, što bi moglo pridonijeti napretku u dijagnostici i prognozi te boljem razumijevanju patogeneze agresivnog parodontitisa.Tehnologija LC-MS/MS pokazala se učinkovitom kad je riječ o proteomskoj analizi gingivnog tkiva.
Source: Acta Stomatologica Croatica
DOI: 10.15644/asc47/1/2
Institutions: University Hospital Centre Zagreb, University of Zagreb
Language: English
Subfield: Spectroscopy
Field: Chemistry
Domain: Physical Sciences
Open Access status: diamond
OpenAlex ID: W1914776497