Approches Métagénomiques en Microbiologie du Sol: Optimisation des Techniques Conventionnelles et Développement d'une Approche Alternative par Capture de Gènes dans une Bactérie Réceptrice.
Year: 2007
Type: dissertation
Abstract: L’approche métagénomique basée sur l’extraction de l’ADN bactérien directement de l’environnement constitue une véritable révolution en microbiologie environnementale en donnant accès aux bactéries non cultivées. Cependant, des biais demeurent liés à l’extraction de l’ADN métagénomique à partir d’environnements comme le sol. Nos objectifs ont été d’une part de tenter d’optimiser les méthodologies d’extraction de l’ADN métagénomique et d’autre part de contourner les biais d’extraction en développant une approche basée sur l’utilisation d’une souche bactérienne capable à terme de piéger in situ des gènes provenant de l’ADN des bactéries du sol. Le principe de cette approche est de permettre l’échange allélique entre des gènes du métagénome et des séquences cibles introduites dans le génome de l’hôte, opération qui s’accompagnera de l’élimination d’une cassette contenant deux gènes dont l’expression induite par l’expérimentateur a un effet létal sur la cellule bactérienne.
Source: HAL
Author: Nathalie Lombard
Institution: Laboratoire Ampère
Language: French
Subfield: Molecular Biology
Domain: Life Sciences
Open Access status: green
OpenAlex ID: W2787194201