Year: 2014
Type: article
Abstract: Im Rahmen des Synbreed Projektes wurden zahlreiche Hühnerrassen phänotypisch charakterisiert, die sowohl kategoriale Merkmale alsauch Körpermaße einschlossen. Dieses Synbreed Chicken Biodiversity Panel (SCBP) umfasst mehr als 2.400 Tiere aus 111 verschiedenen Rassen und Farbschlägen unterschiedlicher geographischer Herkunft, darunter zwei Wildhuhnpopulationen und kommerzielle Zuchtlinien. In dieser Studie waren Daten von 1.967 Individuen verfügbar, die an mehr als 445.000 SNP-Loci mit dem Affymetrix 600k Axiom Hühner SNP-Array typisiert wurden. Genomweite Assoziationsanalysen identifizierten präzise genomische Regionen bekannter Mutationen für dieMerkmale gelbe Hautfarbe und Rosenkamm. Darüber hinaus wurden Cluster-Analysen mit 89 Populationen mit einem Subset autosomaler SNPs durchgeführt, die in Wildpopulationen polymorph waren, um die Beziehung zwischen den Rassen zu visualisieren. Die Ergebnisse zeigten, dass die meisten Rassen gemeinsame Cluster entsprechend der angenommenen phylogenetischen Verwandtschaft bildeten. Das SCBP stellt eine wertvolle Ressource für hochauflösende Analysen der genetischen Vielfalt und der genomischen Kartierung phänotypischer Variabilität dar.
Source: OpenAgrar
Authors: Steffen Weigend, Ulrike Janßen-Tapken, Michaël Erbe, Ulrike Ober, Annett Weigend, R. Preisinger, Henner Simianer
Language: German
Subfield: Genetics
Domain: Life Sciences
SDG: Zero hunger
Open Access status: green
OpenAlex ID: W2917218614