La ruminococcine C, caractérisation génétique et dissémination au sein du microbiote intestinal
Year: 2010
Type: dissertation
Abstract: Ruminococcus gnavus El est une bactérie anaérobie stricte à Qram positif, qui appartient au groupe phylogénétique Clostridium coccoides et a été isolée du microbiote intestinal d'un homme sain. In vivo et sous la dépendance de la trypsine, la souche El produit la Ruminococcine C (RumC), bactériocine active contre C. perfringens, qui a été précédemment purifiée à partir de contenus caecaux de rats monoxéniques. Une région de 15kb du chromosome de R. gnavus E1 portant le cluster de gènes impliqué dans la biosynthèse de RumC a été caractérisée. Elle contient 17 ORF organisés en opérons impliqués dans la régulation, l'immunité, la synthèse et la sécrétion de RumC. De façon originale, 5 gènes partageant 61 à 86% d'identité et susceptibles de coder une bactériocine de type RumC ont été identifiés sur le cluster. Les produits des gènes rumC1, rumC[4] et rumC[5] correspondent aux peptides purifiés à partir de contenu caecal. Le rôle de rumC[2] et rumC[3] reste à déterminer. L'utilisation d'animaux gnotobiotiques a permis de montrer que le cluster rumC est hébergé par un élément mobile qui peut être transféré in vivo à une autre souche appartenant au groupe C. coccoides. L'analyse bioinformatique suggère que cet élément serait un transposon conjugatif de la famille du Tn916. Une étude complémentaire montre que les gènes rumC sont largement disséminés dans le microbiote dominant de l'Homme, au sein du groupe C. coccoides. Ces observations suggèrent que RumC jouerait un double rôle : d'une part dans le pouvoir colonisateur des souches productrices en éliminant les compétiteurs directs, d'autre part dans la protection de l'hôte par son action contre le pathogène C. perfringens.
Author: Ange Pujol
Language: French
Subfield: Infectious Diseases
Field: Medicine
Domain: Health Sciences
Open Access status: green
OpenAlex ID: W383456985