Year: 2024
Type: conference-paper
Abstract: Данная работа посвящена исследованию с помощью эксперимента молекулярной динамики автономной вне белковой глобулы стабильности трех типов структурных мотивов: SH3-домен, 3α-пучок и 3β-уголок.Структурные мотивы белков, уникальные и компактные по пространственной организации ансамбли элементов вторичной структуры, представляют особую ценность, поскольку являются кандидатами «ядер» сворачивания белка и строительных блоков в «фолдинге», и могут быть использованы в качестве исходных структур в моделировании белка и прогнозировании его третичной организации.Проведен сравнительный анализ геометрических характеристик исследуемых структур в ходе эксперимента молекулярной динамики в составе белка и вне белкового окружения в водной среде: количество гидрофобных взаимодействий и водородных связей, их сохранность в ходе эксперимента; радиус гирации
DOI: 10.17537/icmbb24.45
Language: English
Subfield: Molecular Biology
Domain: Life Sciences
Open Access status: bronze
OpenAlex ID: W4404256143