Variations in Nucleotide Composition and Deviations from Chargaff’s Second Parity Rule in Bacterial Chromosomes
Year: 2024
Type: conference-paper
Abstract: Вариации нуклеотидного состава и отклонения от второго правила Чаргаффа в бактериальных хромосомах Панюков В.В. 1 , Озолинь О.Н. 2 , Киселев С.С. 2 1 Институт математических проблем биологии РАН -филиал Федерального государственного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт прикладной математики им.М.В.Келдыша Российской академии наук» 2 Институт биофизики клетки РАН -обособленное подразделение Федерального государственного бюджетного учреждения науки «Федеральный исследовательский центр «Пущинский научный центр биологических исследований Российской академии наук» [email protected]Широко известное второе правило Чаргаффа заключается в том, что в каждой из комплементарных цепей двухцепочечной ДНК наблюдается приблизительное равенство количества аденина количеству тимина, а количества гуанина -количеству цитозина.Данное правило было предложено более 55 лет назад, но границы допустимых глобальных (для полноразмерной последовательности) отклонений от него до сих пор не были определены.Нами исследована статистика симметрий первого порядка для 38830 бактериальных хромосом.Для анализируемых нуклеотидных последовательностей проведена оценка отклонений абсолютных величин разности количества аденина и тимина, гуанина и цитозина, пуринов и пиримидинов от второго правила Чаргаффа.Значительные вариации симметрий первого порядка найдены в 1286 хромосомах.На основании неравенства Высочанского -Петунина определён порог экстремальности отклонения от второго правила Чаргаффа.Обнаружено 24 хромосомы с экстремально высоким уровнем различия между количеством пуринов и количеством пиримидинов.
DOI: 10.17537/icmbb24.58
Authors: V.V. Panyukov, O.N. Ozoline, S.S. Kiselev
Language: English
Subfield: Molecular Biology
Domain: Life Sciences
Open Access status: bronze
OpenAlex ID: W4404256346