Identification of Pharmacologically Relevant Mutations in Endometrial Cancer by Whole-exome Sequencing of Ffpe Tumour Samples
Year: 2024
Type: article
Study design: Observational Study
Abstract: Endometrial cancer is a prevalent gynaecologic cancer, but it is far from being homogeneous.It shows an exceptionally diverse genetic background and requires highly personalised treatment plans.In this study, we performed whole-exome sequencing (WES) on formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tumour samples from 13 patients with histologically confirmed endometrial cancer in order to identify pharmacologically relevant mutations.This study focused on oncogenic and tumoursuppressor gene mutations that novel therapies might target.Variants in the PIK3CA, PTEN, KRAS, ARID1A, TP53 and mismatch repair genes (MLH1 and MSH2) were interesting.We identified 352 unique variants, with significant mutations observed in PIK3CA (8 patients), PTEN (6 patients), KRAS (4 patients) and ARID1A (5 patients).The mutations were classified as either pathogenic or likely pathogenic.These could be potential targets for existing or experimental therapies.We have found several mutations, possibly actionable by drugs like PI3K inhibitors, mTOR inhibitors and immune checkpoint inhibitors.This research demonstrates the massive potential of WES to reveal the genetic background of endometrial cancer that could help clinicians refine and personalise the treatment options of these patients. RezumatCancerul endometrial este o malignitate ginecologică frecventă, dar este departe de a avea un profil omogen.Prezintă un bagaj genetic excepțional de divers și necesită planuri de tratament personalizate.În acest studiu, am utilizat secvențierea întregului exom (WES) pe probe de tumoră fixate în formol, încorporate în parafină (FFPE) de la 13 paciente cu cancer endometrial confirmat histologic pentru a identifica mutații relevante farmacologic.Analiza a vizat oncogene cheie și gene supresoare tumorale care ar putea fi vizate de terapii noi.Variante din genele PIK3CA, PTEN, KRAS, ARID1A, TP53 și repararea nepotrivirii (MLH1 și MSH2) au fost de interes.Am identificat 352 de variante unice, cu mutații semnificative observate în PIK3CA (8 paciente), PTEN (6 paciente), KRAS (4 paciente) și ARID1A (5 paciente).Mutațiile au fost clasificate fie ca fiind patogene sau probabil patogene.Acestea ar putea fi ținte potențiale pentru terapiile existente sau experimentale.Am identificat mai multe mutații posibil acționabile de medicamente precum inhibitorii PI3K, inhibitorii mTOR și inhibitorii punctelor de control imun.Această cercetare demonstrează potențialul
Source: FARMACIA
Author: ROBERT BOTEA
Language: English
Subfield: Cancer Research
Domain: Life Sciences
Open Access status: diamond
OpenAlex ID: W4404419549