Complete genome characterization of mcr-1-mediated colistin-resistant Escherichia coli from outpatients in Bulgaria
Year: 2025
Type: article
Abstract: This study reports the emergence of mcr-1 -mediated colistin resistance in human Escherichia coli isolates from Bulgaria. Three colistin-resistant E. coli isolates were obtained from outpatient urine specimens. They were subjected to PCR for detection of mcr genes and conjugation experiments. Whole-genome sequencing was employed to analyze the genomic characteristics of the isolates. PCR identified mcr-1 in all isolates. In E. coli of sequence type (ST) 2067, mcr-1.1 was found on a self-transmissible IncI2 plasmid, while mcr-1.32 was chromosomal in the remaining two ST131 E. coli isolates. E. coli ST2067 co-harbored quinolones resistance mutations ( gyrA D87N , gyrA S83L , parC S80I ), β-lactam ( bla TEM-30 ) and aminoglycoside ( aadA1 , aac(3)-IId ) resistance genes. This report further confirms the role of IncI2 conjugative plasmids in the dissemination of mcr genes. Our findings involving chromosomal mcr-1 in high-risk ST131 E. coli strains from outpatients underscores the need for enhanced surveillance and systematic screening to combat colistin resistance. En este estudio se informa de la aparición de resistencia a la colistina mediada por mcr-1 en cepas humanas de Escherichia coli procedentes de Bulgaria. Se obtuvieron tres aislados de E. coli resistentes a la colistina a partir de muestras de orina de pacientes ambulatorios. Se sometieron a PCR para la detección de genes mcr y a experimentos de conjugación. Se empleó la secuenciación del genoma completo para analizar las características genómicas de los aislados. La PCR identificó mcr-1 en todos los aislados. En E. coli de tipo de secuencia (ST) 2067, mcr-1.1 se encontró en un plásmido IncI2 autotransmisible, mientras que mcr-1.32 era cromosómico en los dos aislados restantes de E. coli ST131. E. coli ST2067 albergaba mutaciones de resistencia a quinolonas ( gyrA D87N , gyrA S83L , parC S80I ), a β-lactámicos ( bla TEM-30 ) y a aminoglucósidos ( aadA1 , aac(3)-IId ). Este informe confirma aún más el papel de los plásmidos conjugativos IncI2 en la diseminación de genes mcr . El hallazgo de mcr-1 cromosómico en cepas de E. coli ST131 de alto riesgo procedentes de pacientes ambulatorios subraya la necesidad de mejorar la vigilancia y el cribado sistemático para combatir la resistencia a la colistina.
Language: English
Subfield: Molecular Medicine
Domain: Life Sciences
Open Access status: hybrid
Estimated APC paid: $2,280
Award: G1859725369
OpenAlex ID: W4407120484