Genome-wide association analysis of yield-related traits in taro and analysis of key gene CeRR1
Year: 2025
Type: article
Abstract: 摘要：产量是芋育种核心目标性状，通过对芋产量相关性状的全基因组关联分析，筛选与芋产量性状显著关联的SNP位点并挖掘关键候选基因，可为芋高产育种提供理论基础。本研究对105份芋核心种质重测序，分析获得了6,295,445个高质量SNP标记，聚类分析将105份芋种质分为4个亚群；进一步对该群体母芋总重、子芋总重和子芋数3个产量相关性状进行考察分析， 3个性状均表现出广泛的表型变异，变异系数为19.39%-26.35%；全基因组关联分析共检测到99个与芋产量相关性状显著关联的SNP位点并挖掘鉴定到38个候选基因，主要涉及大分子物质运输、植物生长素合成和淀粉-糖代谢等生物学过程，其中在子芋数显著关联位点SLG14_87451620筛选到拟南芥AtARR1同源基因CeRR1（EVM0000500），推测该基因参与多子芋侧球茎分化。实验证实CeRR1定位于细胞核，在根和芽中高表达，其表达量与子芋数呈负相关。VIGS试验可有效沉默CeRR1，芋侧球茎中细胞分裂素ZR含量显著升高，说明CeRR1可能通过调控细胞分裂素合成进而参与调控芋侧球茎分化。本研究结果为芋产量性状遗传改良和高产芋新品种选育提供了重要的理论依据和技术支撑。
Source: Scientia Sinica Vitae
Institution: Nanchang Normal University
Language: English
Subfield: Genetics
Domain: Life Sciences
SDG: Zero hunger
Open Access status: bronze
OpenAlex ID: W4415568870