Isolation of Cryptococcus gattii (genotype VGI) from a specimen of Pinus. An approach to its natural habitat in México City
Year: 2025
Type: article
Abstract: Background: In Mexico, Cryptococcus gattii sensu lato has been identified as the etiologic agent in approximately 10.8% of cryptococcosis cases; however, its isolation from natural sources, which would confirm its existence in the environment, has not been successful. Objective: To isolate C. gattii from environmental samples collected from trees within the movement area of a patient diagnosed with cryptococcosis caused by this species. Methods: Based on a database of clinical isolates characterized as C. gattii , a patient was contacted and his route of movement was obtained; through a geospatial analysis, nearby trees were located. Tree hollows were sampled and the Cryptococcus isolates obtained were biochemically and genetically typed. Results: Four Cryptococcus isolates were obtained from the trees Schinus molle , Erythrina coralloides and from a specimen of the genus Pinus : three of them were characterized as Cryptococcus neoformans sensu stricto and one as C. gattii sensu stricto. Conclusions: Using a geographic information system led to delimit an environmental sampling area, resulting in the first documented report in Mexico of the isolation of C. gattii genotype VGI in nature. Antecedentes: En México, Cryptococcus gattii sensu lato ha sido identificado como agente etiológico en aproximadamente el 10.8% de los casos de criptococosis; sin embargo, su aislamiento a partir de fuentes naturales, que permitiría confirmar su permanencia en el ambiente, no ha sido exitoso. Objetivos: Aislar C. gattii a partir de muestras ambientales recogidas de árboles ubicados en el área de desplazamiento de un paciente diagnosticado con criptococosis causada por esta especie. Métodos: Partiendo de una base de datos de aislamientos clínicos caracterizados como C. gattii se estableció contacto con un paciente con el fin de conocer su área de movilidad; mediante un análisis geoespacial se ubicaron y muestrearon los árboles cercanos. Se tomaron muestras en oquedades de los árboles y los aislamientos obtenidos fueron tipificados bioquímica y genéticamente. Resultados: A partir de ejemplares de árboles de las especies Schinus molle y Erythrina coralloides, y de un ejemplar del género Pinus, se obtuvieron cuatro aislamientos del género Cryptococcus , tres de los cuales fueron caracterizados como Cryptococcus neoformans sensu stricto y uno como C. gattii sensu stricto. Conclusiones: El uso de un sistema de información geográfica permitió delimitar un área de muestreo ambiental y el aislamiento de la naturaleza de C. gattii genotipo VGI, hecho que constituye el primero documentado en México.
Institution: Universidad Nacional Autónoma de México
Language: English
Subfield: Epidemiology
Field: Medicine
Domain: Health Sciences
Open Access status: hybrid
Estimated APC paid: $2,500
OpenAlex ID: W4416642641