Examination of bacteria with Illumina MiSeq 16s rRNA gene sequencing in the coastal areas of the Marmara Sea
Year: 2023
Type: dissertation
Abstract: Marmara Denizi (Türkiye) ekolojik olarak değerli bir deniz ekosistemidir. Marmara Denizi Üsküdar sahilinden 2 örnek alınmış ve bu örnekler kimyasal ve yeni nesil dizileme ile analiz edilmiştir. Ayrıca örneklerden toplam bakteri sayılarının belirlenmesi için besiyerlerine ekim yapılmıştır. 16S rRNA genlerinden (Illumina Miseq) elde edilen verilere göre bu habitatlarda Bacteria (99.45%), Archaea (0.50%)’ya göre daha baskın olarak bulunmuştur. Proteobacteria şubesinin temsilcileri en baskın cinsler olarak tespit edilmiştir. İncelenen örneklerde Archaea Domaininden Nanoarchaeota ve Crenarchaeota şubesinin üyelerine rastlanırken Bacteria Domaininden 15 farklı bakteri şubesine rastlanmıştır. Sonuç olarak, Marmara Denizi bakteriyal cins çeşitliliğinin daha baskın olduğu bir habitat olmakla beraber arkelere de ev sahipliği yapan özgün bir habitattır.
Author: Badeli, Nazlıcan
Language: Turkish
Subfield: Ecology
Field: Environmental Science
Domain: Physical Sciences
SDG: Life below water
Open Access status: green
OpenAlex ID: W7132638467