Pneumocystis and its interaction with the lung microbiota and microbiome: an integrative narrative review
Year: 2026
Type: article
Abstract: El pulmón, tradicionalmente considerado un órgano estéril, se reconoce hoy como un ecosistema microbiano complejo que alberga una microbiota diversa con funciones estructurales e inmunomoduladoras. En este contexto, Pneumocystis jirovecii un hongo oportunista atípico históricamente asociado con infecciones en pacientes inmunocomprometidos, ha emergido como un posible modulador del microbioma pulmonar, incluso en individuos inmunocompetentes. Esta revisión narrativa integrativa analiza la evidencia disponible sobre la interacción entre Pneumocystis, la microbiota y el microbioma pulmonar. Se realizó una búsqueda sistemática en bases de datos biomédicas internacionales hasta septiembre de 2025, seleccionando estudios originales relevantes. Los hallazgos indican que la infección o colonización por Pneumocystis se asocia con una reducción de la diversidad microbiana pulmonar y una reorganización de la comunidad microbiana. Funcionalmente se observan alteraciones en importantes rutas metabólicas. En conjunto, los resultados sugieren que P. jirovecii podría actuar como modulador inmunometabólico y del ecosistema del microbioma pulmonar. Se propone avanzar hacia estudios multiómicos integrados que permitan establecer relaciones causales y evaluar el potencial diagnóstico y terapéutico de esta interacción en enfermedades respiratorias crónicas e infecciones oportunistas. Pneumocystis and its interaction with the lung microbiota and microbiome: an integrative narrative review Abstract: The lung, traditionally considered a sterile organ, is now recognized as a complex microbial ecosystem harboring a diverse microbiota with structural and immunomodulatory functions. In this context, Pneumocystis jirovecii, an atypical opportunistic fungus historically associated with infections in immunocompromised patients, has emerged as a potential modulator of the lung microbiome, even in immunocompetent individuals. This integrative narrative review analyzes the available evidence on the interaction between Pneumocystis, the microbiota, and the lung microbiome. A systematic search of international biomedical databases was conducted up to September 2025, selecting relevant original studies. The findings indicate that Pneumocystis infection or colonization is associated with a reduction in lung microbial diversity and a reorganization of the microbial community. At the functional level, alterations in important metabolic pathways are observed. Taken together, the results suggest that P. jirovecii could act as an ecological and immune-metabolic modulator of the lung microbiome. We propose moving toward integrated multi-omic studies to establish causal relationships and evaluate the diagnostic and therapeutic potential of this interaction in chronic respiratory diseases and opportunistic infections. Keywords: Pneumocystis, lung microbiota, lung microbiome, dysbiosis, microbial ecology.
Language: Spanish
Subfield: Epidemiology
Field: Medicine
Domain: Health Sciences
Open Access status: hybrid
OpenAlex ID: W7196953239