The impact of toxins on kin discrimination and horizontal gene transfer in Bacillus subtilis
Year: 2026
Type: dissertation
Abstract: Sorodstveno razlikovanje pri bakteriji Bacillus subtilis omogoča prepoznavanje sorodnih in manj sorodnih sevov. Med rojenjem se roji sorodnih sevov zlijejo (»KIN« fenotip), medtem ko manj sorodni sevi na mestu stika tvorijo jasno mejno linijo (»NON KIN« fenotip). Sorodstveno razlikovanje je povezano tudi s horizontalnim genskim prenosom, saj manj sorodni sevi DNA izmenjujejo učinkoviteje, kar je povezano s stresno indukcijo kompetence. Namen magistrskega dela je bil ugotoviti, kako delecije genov, povezanih s toksini, celično ovojnico in mobilnimi genetskimi elementi, vplivajo na sorodstveno razlikovanje in izmenjavo DNA. Pripravili smo posamezne in večkratne mutante različnih sevov B. subtilis ter fenotip določili s testom združevanja rojev. Večina posameznih delecij ni spremenila »NON KIN« fenotipa. Izjemi sta bili deleciji yxiD in xpf, ki sta pri določenih kombinacijah visoko sorodnih sevov povzročili »KIN« fenotip, kar kaže na sevno specifične učinke. Večkratne delecije v sevu PS-216 niso odpravile mejne linije s sevom PS-218. Po prehodu kombinacije PS-216 ΔyxiD/PS-11 v KIN fenotip je frekvenca transformacije padla pod mejo detekcije. Rezultati kažejo, da je sorodstveno razlikovanje večgenska, kombinatorna lastnost, povezana s horizontalnim prenosom DNA.
Author: Sočič, Aleksander
Language: Slovenian
Subfield: Genetics
Domain: Life Sciences
SDG: Zero hunger
Open Access status: green
OpenAlex ID: W7221733666