Análise in Silico Da Expressão Gênica Da Podoplanina Na Policitemia Vera Utilizando Dados Públicos De Transcriptômica
Year: 2026
Type: article
Abstract: Introdução A Policitemia Vera (PV) é uma neoplasia mieloproliferativa BCR::ABL1- negativa cuja principal causa de morbimortalidade está relacionada a eventos trombóticos. A interação da podoplanina (PDPN) com o receptor plaquetário CLEC-2, desempenha um papel relevante e de grande interesse na tromboinflamação. Entretanto, o perfil de expressão gênica na PV ainda está pouco elucidado. Objetivo Avaliar a expressão diferencial da PDPN em pacientes com PV por meio da análise de dados públicos de transcriptômica. Material e métodos Realizou-se um estudo in silico utilizando dados públicos de transcriptômica disponíveis no Gene Expression Omnibus (GEO). Foram selecionadas séries de expressão gênica em seres humanos contendo pacientes com PV e controles saudáveis, com dados de microarray passíveis de análise pelo GEO2R, excluindo-se estudos duplicados, sem grupo controle ou realizados em modelos experimentais. Ao final da seleção, foram incluídas três séries independentes (GSE103237, GSE174060 e GSE47018), totalizando 76 amostras (47 pacientes com PV e 29 controles saudáveis). A expressão diferencial da PDPN foi analisada no GEO2R utilizando o pacote limma e correção de Benjamini-Hochberg (FDR < 0,05). Resultados Foram analisadas três séries transcriptômicas independentes: GSE103237 (n = 34; 17 pacientes com PV e 17 controles saudáveis), GSE174060 (n = 17; 11 pacientes com PV e 6 controles saudáveis) e GSE47018 (n = 25; 19 pacientes com PV e 6 controles saudáveis). O gene PDPN foi representado por quatro probes no GSE103237, uma no GSE174060 e três no GSE47018. Entre as oito probes avaliadas, apenas a 11724735_a_at, presente no GSE103237, apresentou aumento significativo da expressão em pacientes com PV em relação aos controles (logFC = +0,1070; p = 0,00063; FDR = 0,00331). No GSE174060, a probe correspondente ao PDPN apresentou logFC = −0,0386 (p = 0,519; FDR = 0,763). No GSE47018, as três probes correspondentes ao PDPN apresentaram valores de p entre 0,147 e 0,480 e FDR entre 0,711 e 0,885. Discussão Entre as oito probes correspondentes ao PDPN avaliadas nas três séries transcriptômicas, apenas uma apresentou expressão diferencial significativa. A ausência de reprodutibilidade desse achado entre as demais séries evidencia um padrão heterogêneo de expressão do PDPN na PV. Essa variabilidade pode refletir diferenças no tamanho amostral, nas plataformas de microarray empregadas, na origem e composição celular das amostras, nas características clínicas dos pacientes e nas estratégias de processamento dos dados. Conclusão A análise in silico evidenciou comportamento heterogêneo da expressão gênica da PDPN entre as coortes de pacientes com PV avaliadas. Em conjunto, os resultados não fornecem evidências transcriptômicas consistentes de expressão diferencial da PDPN na PV, sugerindo que sua participação na fisiopatologia da doença permanece inconclusiva quando avaliada exclusivamente por análises transcriptômicas. Assim, estudos funcionais e validações em coortes independentes são necessários para esclarecer o papel da PDPN na tromboinflamação associada à PV. Apoio financeiro CAPES, CNPq, FAPEAM.
Language: English
Subfield: Hematology
Field: Medicine
Domain: Health Sciences
Open Access status: diamond
OpenAlex ID: W7223099372