Kanser Tedavisine Yönelik DNA Polimeraz Gama Enzimini Hedefleyerek Mitokondriyel Baz Eksizyon Tamir Mekanizmasını Bloke Eden Küçük Molekül İnhibitörlerinin Belirlenmesi Ve Etkinliklerinin Saptanması
Description: Birçok kemoterapötik ajan ve radyasyon sitotoksik etkilerini DNA hasarını indükleyerek gösterir. Fakat DNA tamir yolakları DNA hasarına direnç göstererek bu hasarın öldürücü etkilerinden hücreyi korur ve böylece genomik kararlılığı sağlar. Bu nedenle, kanser hücresindeki DNA tamir yolakları kanser tedavisinin önünde çok önemli bir engeldir. Kanser tedavisinin başarılı olması normal hücrelere zarar vermeden seçici olarak tümör hücresinin öldürülmesine bağlıdır. Bu seçici sitotoksisite, DNA tamirine bağlı sentetik letal etkileşimler üzerinden gerçekleşebilir. MLH1 ve DNA polimeraz gama (Polg) arasındaki sentetik letal ilişki, MLH1 mutasyonunun dolayısıyla yanlış eşleşme tamir hasarının neden olduğu polipsiz kolorektal kanser (Lynch sendromu) hücrelerinin, normal hücrelere zarar vermeden tedavi edilmesini, Polg nın inhibisyonu ile mümkün kılar. Bu projede, Polg yı dolayısıyla mitokondriyel BER yolağını inhibe eden yeni küçük molekül inhibitörü(leri) bulmak, etkinliğini saptamak ve tanımlamak için, bilgisayar ortamında (in siliko) moleküler ``docking`` yaklaşımı ile ve ilaç olma olasılığı yüksek ticari molekül kütüphanesi küçük molekülleri tarandı. Küçük moleküllerin Pol? proteinine bağlanma kinetiği yüzey plazmon rezonans analizi ile belirlendi. Bu moleküllerden, obcun19 molekülünün Polg nın DNA sentez aktivitesini, mitokondriyel BER yolağını inhibe ettiği ve sentetik letal yaklaşımı ile HCT116 kolon kanser hücresine seçici sitotoksisite gösterdiği belirlendi. Bu molekülün, MLH1 geni mutant HCT116 hücrelerinde, MLH1 geni bulunan HCT116chr3(V1) kontrol hücrelerine kıyasla mitokondriyel apoptozu, mitokondriyel membran potansiyelini artırdığı ve mtDNA da daha fazla oksidatif hasara neden olduğu gösterilmiştir. Bu veriler, MLH1 mutasyonu nedeniyle oluşan kanserlerin seçici tedavisi için obcun19 un, potansiyel yeni bir molekül olarak geliştirilebileceğini göstermektedir. Bu nedenle, inhibitörün in vivo toksisitesini araştırmak için HCT116 hücresi kullanılarak çıplak farede ksenograft çalışmaları başlatılmıştır.
Funding type: research
Funder scheme: KBAG
Start date: 2013-04-01
End date: 2016-11-01
Investigators: Meltem Muftuoglu, batu erman, MUSTAFA CENGİZ YAKICIER, Burak Erman
Funded outputs count: 3
Funder award ID: 212T026
OpenAlex ID: G2832582425