Diversity in sporulation and spore properties of foodborne Bacillus strains
Year: 2017
Type: dissertation
Abstract: Bacteriële sporulatie is een laatste strategie tegen uithongering, en resulteert in de formatie van inactieve, resistente (endo)sporen. Sporen vormen een groot probleem voor de voedselindustrie, omdat behandelingsmethoden deze verontreinigende elementen meestal niet volledig inactiveren. Hierdoor kunnen overlevende sporen germineren en uitgroeien tot een nieuwe populatie, resulterend in voedeselbederf. Heterogeniteit op spore/cel niveau en variatie tussen stammen in sporulatie eigenschappen belemmeren voorspellingen en controle over sporen in de voedselindustrie. Dit proefschrift beschrijft deze twee fenomenen uitgebreid in model laboratorium stammen en industrieel relevante Bacillus isolaten uit voedsel. Ten eerste hebben we met fluorescentie microscopie het voorkomen van het "sporulatie lyse" fenotype in sporulerende genetisch identieke cellen van B.subtilis aangetoond, wat een ander aspect van sporulatie gerelateerde heterogeniteit laat zien. Ten tweede liet RNA-seq conservatie zien van sporulatie genexpressie programma's in B. subtilis en B. amyloliqueafaciens stammen. Dit suggereert dat de verschillende fenotypische eigenschappen van hun sporen het gevolg zijn van verschillen in de aanwezigheid van genen en sequenties, in plaats van het transcriptiegedrag van de stammen. Tenslotte zijn de germinatie fenotypes in verband gebracht met de genomische inhoud van B. subtilis en B. thermoamylovorans. Dit heeft geleid tot de identificatie van genetische factoren die verantwoordelijk zijn voor inter-stam variatie, zoals het spoVA2mob operon en sequenties van ger genen. De bevindingen van deze studie hebben belangrijke consequenties voor de huidige gang van zaken binnen de voedingsmiddelenindustrie, en trekt de huidige procedures en technieken in twijfel. Bovendien worden suggesties gedaan voor de detectie van problematische spoorvormers.
Author: Antonina O. Krawczyk
Language: English
Subfield: Genetics
Domain: Life Sciences
SDG: Zero hunger
Open Access status: green
OpenAlex ID: W2747855804