Year: 2022
Type: article
Abstract: УкраїнаПодано результати дослідження щодо розробки гібридної індуктивної моделі кластеризації профілів експресій генів на основі комплексного застосування алгоритму кластеризації SOTA (Self-Organizing Tree Algorithm) та згорткової нейронної мережі.Модель зображена у вигляді структурної блок-схеми покрокової процедури реалізації процедури кластеризації у рамках індуктивної технології об'єк тивної кластеризації на першому кроці і застосування згорткової нейронної мережі до даних експресій генів у сформованих кластерах на другому кроці.Формування проміжних кластеризацій здійснювалося на основі аналізу значень критерію балансу, який містив як компоненти внутрішні та зовнішні критерії якості кластеризації.Остаточний вибір оптимальної кластеризації відповідав максимальному значенню точності класифікації об'єктів під час застосування згорткової нейронної мережі.Ключові слова: алгоритм кластеризації SOTA, згорткова нейронна мережа, дані експресій генів, кластеризація профілів експресій генів, індуктивна технологія об'єктивної кластеризації, класифікація даних, точність класифікації.Постановка проблеми.Розробка гібридних моделей кластеризації профілів експресій генів на основі комплексного застосування методів інтелектуального аналізу даних та машинного навчання є одним із актуальних напрямів сучасної біоінформатики.Особливістю даних експресій генів є велика кількість генів, що визначають стан біологічного об'єкта, що досліджується, велика розмірність профілю експресій генів, яка визначається кількістю об'єктів, що досліджувалися, при формуванні експериментальних даних і відсутність інформації щодо кількості кластерів, на які необхідно розділити експериментальні дані.Традиційні алгоритми кластеризації у більшості випадків орієнтовані на низькорозмірні (об'єкти характеризуються невеликою кількістю атрибутів) дані.Крім того, сучасним алгоритмам кластеризації властива похибка відтворюваності, сутність якої полягає у
Language: English
Subfield: Molecular Biology
Domain: Life Sciences
Open Access status: diamond
OpenAlex ID: W4312744729