Regiones cloroplásticas como herramientas para la identificación molecular de Campomanesia xanthocarpa O. Berg. en Paraguay
Year: 2022
Type: article
Abstract: El género Campomanesia (Myrtaceae) tiene varios representantes en Paraguay, entre los que se encuentran C. xanthocarpa (guavira pytã), especie destacada por su utilización en medicina tradicional y alimentación, y que junto con otras especies co-genéricas forma parte de la dieta de comunidades mbya guaraní. El objetivo de este trabajo fue seleccionar regiones cloroplásticas de C. xanthocarpa que puedan utilizarse para DNA barcoding y como herramientas para estudios filogeográficos. La búsqueda de secuencias disponibles en el GenBanK permitió identificar que hay disponibles solo 12 accesiones de regiones cloroplásticas para esta especie, ninguna correspondiente a especímenes de Paraguay. El análisis de las mismas permitió identificar cinco sitios polimórficos para C. xanthocarpa en secuencias del gen matk, pudiendo esta región ser utilizada para estudios filogeográficos. En las accesiones correspondientes al gen RuBisCO no se encontró ningún sitio polimórfico. El alineamiento con secuencias de especies cogenéricas identificó sitios que podrían ser específicos. Este análisis deja en evidencia la utilidad de estas regiones cloroplásticas y lanecesidad de analizar estas y otras, en poblaciones de Paraguay, de manera de identificar polimorfismos y sitios variables interespecíficos útiles para caracterizar poblaciones de esta especie, así como en la identificación y trazabilidad de la misma. Abstract The genus Campomanesia (Myrtaceae) has several representatives in Paraguay, among which are C. xanthocarpa, a species noted for its use in traditional medicine and food, along with other co-generic species is part of the diet of Mbya Guaraní communities. The aim of this work is to select chloroplastic regions of C. xanthocarpa that is used for DNA barcoding and as tools for phylogeographic studies. The search for sequences available in GenBanK identified that there are only 12 accessions of chloroplastic regions available for this species, none corresponding to specimens from Paraguay. The analysis of them allowed to identify 5 polymorphic sites for C. xanthocarpa in sequences of the matk gene, being able this region to be used for phylogeographic studies. In the accessions corresponding to the RuBisCO gene, no polymorphic sites were found. Alignment with cogeneric species sequences identified sites that could be specific. This analysis shows the usefulness of these regions and the need to analyze these and others in populations of Paraguay, in order to identify polymorphisms and interspecific variable sites useful to characterize populations of this species, as well as in the identification and traceability of the same. Keywords: Chloroplast, DNA barcoding, guavira pytã, Campomanesia xhantocarpa.
Source: Revista Impacto
Language: Spanish
Domain: Life Sciences
Open Access status: diamond
OpenAlex ID: W7217536160